Sejak digulirnya reformasi, Mahkamah Agung selalu melakukan perubahan, terutama dalam hal pembenahan system manajemen terkait core bussiness Pengadilan, sebagaimana dirumuskan dalam cetak biru Mahkamah Agung 2010-2035. Dalam pada itu, Pengadilan Negeri Balikpapan juga telah melakukan penguatan dalam pemberian pelayanan  kepada masyarakat Balikpapan, antara lain sejak tahun 2018 sampai dengan sekarang telah melaksanakan :

• Performa Pengadilan yang agung melalui Akreditasi Penjaminan Mutu (dengan predikat A Excellent) yang secara sistematis dan berkesinambungan terus dilakukan,
• Pemberian layanan melalui Pelayanan Terpadu Satu Pintu (PTSP)
• Pelayanan pengadilan berbasis elektronik (E-Litigasi; E-Court-yang meliputi e-Filling, e-Payment, e-Summons; EraTeran ; Sistem Informasi Penelusuran Perkara)
• Persidangan perkara pidana secara elektronik
• Pemberian informasi melalui aplikasi Whatsapp (SIMARA)